Тип операції підбирає лікар. Виділяють понад 150 видів. Практичне поширення отримали кілька:
MAGPI-операція ефективна при дистально-стовбурової формі. Головка пеніса робиться плоскою, і сечовипускальний канал не переміщається.
Операція Матьє — можлива при будь-якій формі гіпоспадії. На кожній стороні уретральної пластинки роблять 2 розрізу до самої верхівки голівки, поглиблюють їх до печеристих тел. Лінія розрізу окреслює клапоть шкіри, який загинають догори і підшивають до країв уретральної пластинки. Латеральні «крила» головки зшиваються разом, спочатку відокремивши від кавернозних тел. Це дає можливість формування конічної форми головки.
Операція Снодграсса (операція TIP) — відноситься до універсального типу втручання. Уретральну пластинку поздовжньо розсікають посередині від наявного зовнішнього отвору уретри вгору до головки і відповідно створюють з неї тубус навколо катетера 8Р. Непокритий дорсальний ділянку уретри в подальшому сам епітелізіруется.
Застосовується при будь-якій формі стовбурової гіпоспадії операція Тирша-Дюплея. Від головки до кавернозних тіл хірург робить глибокий надріз з боків, уретральну пластину також тубуляризирует, покриваючи її всебічно клаптями та зшиває їх.
Пластика клаптем на ніжці — метод універсальний. Клапоть складається з слизової оболонки щоки, після чого їм покривають пластинку уретри. Після операції пеніс набуває нормального вигляду (як після обрізання). За бажанням батьків хірург може відтворити крайню плоть (препуциопластика).
